Panoply

Fonctionnalités

Panoply permet de faire des graphes de données geo-referencées à partir de fichiers netCDF, HDF, GRIB

Dans son utilisation la plus basique Panoply permet de lire le contenu des fichiers netCDF (comme "ncdump"), sans avoir recours à la ligne de commande Ce qui peut être pratique pour les utilisateurs peu enclins à taper des lignes de commandes.

  • panoply affiche toutes les variables contenues dans le fichier netcdf avec leur métadonnées

    • panoply lit des fichier netcdf

  • panoply affiche les metadonnées globales du fichier netcdf

    • panoply lit des fichier netcdf

  • panoply trace les graphes des variables selectionnées

- graphe 1D - graphes 2D
graphe1D panoply graphes2D panoply

Autres fontionnalités avancées

  • Ouvrir des jeux de données netCDF et HDF distants stockés sur un site web
  • Créer des tracés de contours en couleur de tableaux géoréférencés latitude-longitude, latitude-verticale, longitude-verticale, heure-latitude ou heure-verticale, découpés à partir de variables multidimensionnelles 2D ou plus grandes.
  • Créer des tracés de contour en couleur de tableaux 2D "génériques" à partir de variables multidimensionnelles 2D ou plus grandes.
  • Créer des tracés linéaires de données provenant de variables multidimensionnelles 1D ou plus.
  • Combiner deux tableaux géoréférencés en un seul tracé en les différenciant, en les additionnat ou en calculant la moyenne.
  • Créer des tracés cartographiques de données de trajectoire sur la base de la convention CF ou d'une convention similaire.
  • Tracer des données lon-lat sur une carte mondiale ou régionale en utilisant l'une des 200 projections cartographiques ou réaliser un tracé linéaire de la moyenne zonale.
  • Superposer les contours ou les masques des continents sur les tracés des cartes longitudes.
  • Utilisez l'une des nombreuses tables de couleurs pour la barre de couleurs de l'échelle, ou appliquez votre propre table de couleurs ACT, CPT ou RGB.
  • Sauvegarder les tracés sur disque sous forme d'images bitmap GIF, JPEG, PNG ou TIFF, ou sous forme de fichiers graphiques PDF ou PostScript.
  • Exportation des tracés de cartes lon-lat en format KMZ.

Téléchargement et Installation

Panoply est une application multiplateforme qui fonctionne sur Macintosh, Windows, Linux et d'autres ordinateurs de bureau. Panoply nécessite l'installation sur votre ordinateur d'un JRE ou d'un JDK compatible avec Java 11 (ou une version ultérieure).

Après avoir installé Java 11 sur votre ordinateur : JRE ou JDK compatible avec Java 11 (ou une version ultérieure).

$ ls -l /usr/local/bin/panoply
lrwxrwxrwx 1 root root 48 oct.  29  2019 /usr/local/bin/panoply -> /home/libes/Documents/NetCDF/PanoplyJ/panoply.sh*

libes@OptiPlex-7460-AIO:~$ more /home/libes/Documents/NetCDF/PanoplyJ/panoply.sh
#!/bin/sh

SCRIPT=`readlink -f $0`
SCRIPTDIR=`dirname $SCRIPT`

java -Xms512m -Xmx1600m -jar $SCRIPTDIR/jars/Panoply.jar "$@"

TP

le répertoire ~/tp/panoply contient quelques fichiers .nc

L'ouverture des fichiers .nc peut se faire soit par le menu file/open de panoply, mais aussi en ligne de commandes

$  panoply ./tp/panoply/nomdufichier.nc

  • regardez le fichier bathybot_MICROCAT_20240203.nc normalisé avec la convention CF et OceanSite

    • voir les dimensions
    • les variables avec leurs attributs
    • voir les attributs globaux
    • tracer un graphe 1D d'une variable DOX1 TEMP

  • regardez le fichier charm_forecast_0day_20180621.nc.nc

  • tracer un graphe Geo2D d'une variable pseudo_nitzschia ou particulate_domoic sur 2 Dimensions geolocalisée Lat/Long

  • on peut se centrer sur la zone de mesures :
    • dans la fenetre plot controls
    • choisir map projection :
      • choisir la projection EquiRectangular Regional
    • centrer sur : -120.0° Longitude / 30° Latitude
    • on peut zoomer avec ctrl alt = (menu plot Zoom Plot in)